متن این حکم به شرح زیر است:

بسم‌الله الرحمن الرحیم

جناب آقای دکتر محمدعلی نجفی

با تشکر فراوان از زحمات جناب آقای دکتر فرجی دانا در دوران مسئولیتشان به عنوان وزیر علوم، تحقیقات و فناوری، براساس اصل 135 قانون اساسی و نظر به مراتب تعهد و سوابق علمی و مدیریتی جنابعالی به موجب این حکم، شما را به سرپرستی وزارت علوم، تحقیقات و فناوری برمی‌گزینم.

امید است با توفیقات الهی و تلاش همه همکاران آن وزارت، اعضای هیأت‌های علمی و دانشجویان دانشگاه‌ها و مراکز تحقیقاتی سراسر کشور، در خدمت به ملت شریف ایران و نظام جمهوری اسلامی با رعایت اصول قانون‌مداری، اعتدال‌گرایی و منشور اخلاقی دولت تدبیر و امید موفق باشید.

گفتنی است؛ نجفی در ابتدای دولت به عنوان رئیس سازمان میراث فرهنگی فعالیت می کرد که پس از استعفا به تیم اقتصادی دولت پیوسته بود.

همچنین در حکم دیگری دکتر رضا فرجی دانا از سوی روحانی به عنوان مشاور رئیس جمهوری در امور علمی و آموزشی منصوب شد.

شایان ذکر است محمدعلی نجفی که هم اکنون ریاست سازمان میراث فرهنگی، صنایع دستی و گردشگری را بر عهده دارد، در سال گذشته موفق نشد رای اعتماد نمایندگان ملت را برای کرسی وزارت آموزش و پرورش به دست آورد که پس از  انتخاب وی به عنوان رئیس سازمان میراث فرهنگی، صنایع دستی و گردشگری توسط رئیس جمهور، تعدادی از نمایندگان مجلس به این حکم اعتراض کردند. وحالا نیز که نجفی به عنوان سرپرست موقت وزارت علوم انتخاب شده، بعید می رسد نگاه مجلسی ها به شیوه مدیریت او تغییری کرده باشد.